More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3477 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
305 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  94.39 
 
 
305 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.33 
 
 
308 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  71.91 
 
 
310 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  74.3 
 
 
312 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  70.85 
 
 
308 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.01 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.7 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.44 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.38 
 
 
300 aa  394  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.78 
 
 
291 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  65.61 
 
 
298 aa  381  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.54 
 
 
315 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27000  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.79 
 
 
302 aa  355  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276058  normal  0.910216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
296 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.94 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3032  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.8 
 
 
297 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2661  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.79 
 
 
313 aa  309  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.46 
 
 
296 aa  295  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.78 
 
 
300 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.14 
 
 
311 aa  242  7e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.07 
 
 
300 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.07 
 
 
300 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1732  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.75 
 
 
301 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000245457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.4 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2676  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.05 
 
 
300 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.64 
 
 
291 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.21 
 
 
294 aa  228  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.75 
 
 
302 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.43 
 
 
310 aa  224  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.65 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.38 
 
 
296 aa  221  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.38 
 
 
296 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.94 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.81 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.72 
 
 
281 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.65 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.04 
 
 
308 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.44 
 
 
317 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.94 
 
 
290 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1170  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  47.01 
 
 
298 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0239338  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.94 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.08 
 
 
309 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.68 
 
 
343 aa  218  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2367  Deleted entry  43.31 
 
 
323 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38264  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.49 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.01 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
296 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.03 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.21 
 
 
281 aa  215  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.14 
 
 
293 aa  215  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.36 
 
 
295 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.28 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.01 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.81 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.91 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2028  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.27 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2125  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  39.67 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.29 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.37 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.36 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.07 
 
 
305 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.02 
 
 
281 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.39 
 
 
297 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.68 
 
 
295 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.81 
 
 
272 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2762  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.8 
 
 
298 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.38 
 
 
314 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.81 
 
 
272 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.04 
 
 
298 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
299 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.02 
 
 
281 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.89 
 
 
306 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.74 
 
 
295 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.65 
 
 
292 aa  209  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1758  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
295 aa  208  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.68 
 
 
281 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.56 
 
 
294 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.98 
 
 
281 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.43 
 
 
303 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1450  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.43 
 
 
303 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.95 
 
 
276 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002308  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.29 
 
 
300 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0099  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.44 
 
 
291 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.47967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.13 
 
 
298 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.13 
 
 
294 aa  205  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.43 
 
 
303 aa  205  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3409  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.51 
 
 
320 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110257  normal  0.0203193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.27 
 
 
289 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.16 
 
 
281 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.73 
 
 
289 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0162  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.83 
 
 
302 aa  203  2e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>