More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2906 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.11 
 
 
285 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.593467  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
276 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
344 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
298 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2734  hypothetical protein  74.12 
 
 
85 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225602  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
327 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  39.49 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.44 
 
 
270 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
272 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 
278 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
317 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
282 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
338 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
282 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
284 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 
277 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
272 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
273 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
289 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
282 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
282 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
282 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  28.98 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
268 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
265 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
280 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
291 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.63 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  33.64 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
274 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
274 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
268 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
275 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
284 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 
280 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  33.64 
 
 
283 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
271 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
286 aa  115  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  37.84 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  35.07 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  31.29 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
281 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 
291 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
271 aa  113  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
291 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  35.71 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 
290 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
282 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
271 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>