More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2831 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  89.27 
 
 
290 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  63.99 
 
 
293 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  63.99 
 
 
293 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  63.99 
 
 
293 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  45.52 
 
 
296 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.48 
 
 
293 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.62 
 
 
292 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  41.38 
 
 
288 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  43.45 
 
 
288 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  41.03 
 
 
288 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  41.03 
 
 
288 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  40.48 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  38.72 
 
 
295 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  37.54 
 
 
285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  38.28 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  38.14 
 
 
290 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  35.79 
 
 
286 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  35.79 
 
 
286 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  35.79 
 
 
286 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  35.44 
 
 
285 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  37.73 
 
 
284 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.51 
 
 
293 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.12 
 
 
273 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  33.33 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  34.66 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  39.15 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3625  luciferase-like protein  41.84 
 
 
202 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  39.15 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  39.15 
 
 
351 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  30.36 
 
 
311 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  33.79 
 
 
284 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.7 
 
 
299 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  37.31 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 
288 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  35.35 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  37.79 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  32.89 
 
 
307 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.85 
 
 
346 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  33.18 
 
 
274 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  33.18 
 
 
276 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  31.49 
 
 
298 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  30.71 
 
 
309 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  32.52 
 
 
289 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  38.54 
 
 
295 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  38.98 
 
 
289 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  27.52 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.06 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  28.86 
 
 
335 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  34.59 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  38.94 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.4 
 
 
283 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.4 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.4 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  32.38 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.73 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  32.98 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  27.94 
 
 
337 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  33.99 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  29.39 
 
 
281 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  30.52 
 
 
339 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  32.08 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  29.89 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.47 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.64 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.74 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.9 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  36.5 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  34.82 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  33.33 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  32.49 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  27.34 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  37.78 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  29.9 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  28.26 
 
 
341 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  30.62 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  32.16 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.96 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.73 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.84 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  32.35 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  28.67 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  27.16 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  30.41 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.38 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  33.18 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  26.09 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  28.95 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  32.61 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  28.57 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  29.61 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  27.98 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  34.04 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  27.76 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  27.76 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  27.76 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  27.76 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>