More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0461 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  95.21 
 
 
188 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  85.25 
 
 
188 aa  317  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  90.28 
 
 
323 aa  280  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  90.78 
 
 
170 aa  280  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  90.71 
 
 
291 aa  277  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  87.5 
 
 
173 aa  275  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  68.61 
 
 
173 aa  197  9e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  59.49 
 
 
190 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  57.4 
 
 
189 aa  193  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
189 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  63.43 
 
 
268 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  59.49 
 
 
190 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  63.43 
 
 
268 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  58.86 
 
 
189 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  58.86 
 
 
189 aa  191  6e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  58.86 
 
 
190 aa  189  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.11 
 
 
176 aa  187  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  64.96 
 
 
184 aa  186  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  56.38 
 
 
250 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.43 
 
 
225 aa  185  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.04 
 
 
176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.53 
 
 
251 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.09 
 
 
170 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.31 
 
 
183 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
185 aa  179  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.46 
 
 
170 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  53.25 
 
 
179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.94 
 
 
787 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  58.57 
 
 
175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  49.17 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.74 
 
 
200 aa  177  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
174 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.03 
 
 
170 aa  177  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  59.12 
 
 
177 aa  177  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  49.17 
 
 
222 aa  177  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  60.9 
 
 
211 aa  177  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.65 
 
 
170 aa  177  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
172 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
172 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
172 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
179 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
179 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
179 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
172 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
173 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
172 aa  176  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
172 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55 
 
 
202 aa  176  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.93 
 
 
167 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  63.24 
 
 
172 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
172 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
177 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
172 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
174 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
191 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
173 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
173 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
174 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.42 
 
 
191 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.04 
 
 
200 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  53.94 
 
 
222 aa  175  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.24 
 
 
169 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.34 
 
 
200 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
173 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
170 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  57.46 
 
 
160 aa  174  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  57.46 
 
 
160 aa  174  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  54.79 
 
 
168 aa  174  9e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
159 aa  174  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  54.61 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.13 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  57.89 
 
 
228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  54.36 
 
 
213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  56.39 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  53.9 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  53.79 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  53.68 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 
167 aa  173  1.9999999999999998e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  57.25 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  57.97 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  57.25 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>