32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0276 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  89.81 
 
 		 218 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  39.52 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  35.68 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  30.95 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  24.88 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>