More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2962 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3884  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  72.37 
 
 		 735 aa  1051    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1035  transketolase central region  60 
 
 		 747 aa  879    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2633  hypothetical protein  53.56 
 
 		 745 aa  785    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2503  hypothetical protein  53.42 
 
 		 745 aa  782    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1956  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.84 
 
 		 721 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1294  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  62.38 
 
 		 727 aa  864    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1045  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  70.11 
 
 		 738 aa  1021    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2566  putative bifunctional enzyme  59.56 
 
 		 743 aa  841    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104347  hitchhiker  0.000000000000144647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6420  2-oxoisovalerate dehydrogenase  49.72 
 
 		 736 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3017  transketolase, central region  58.94 
 
 		 761 aa  866    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2962  transketolase, central region  100 
 
 		 733 aa  1491    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0290304  normal  0.0965541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2954  transketolase, central region  62.04 
 
 		 727 aa  867    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.998903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1976  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.29 
 
 		 687 aa  636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2156  transketolase central region  51.28 
 
 		 790 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2640  Transketolase domain protein  50.14 
 
 		 759 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2727  transketolase, central region  62.52 
 
 		 727 aa  877    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.556431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0901  transketolase, central region  61.99 
 
 		 763 aa  887    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.542357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2795  transketolase, central region  60.79 
 
 		 761 aa  883    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2022  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.7 
 
 		 721 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3610  transketolase domain-containing protein  47.06 
 
 		 805 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3370  transketolase domain-containing protein  47.07 
 
 		 792 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  28.72 
 
 		 736 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  31.72 
 
 		 710 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  29.87 
 
 		 678 aa  206  9e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  27.79 
 
 		 688 aa  200  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  31.16 
 
 		 692 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  31.29 
 
 		 692 aa  188  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  32.19 
 
 		 693 aa  187  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  28.55 
 
 		 701 aa  180  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  30.97 
 
 		 657 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  33.82 
 
 		 325 aa  168  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  33.82 
 
 		 325 aa  168  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  27.9 
 
 		 617 aa  167  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  28.33 
 
 		 709 aa  165  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.53 
 
 		 325 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  26.36 
 
 		 659 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  33.43 
 
 		 320 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1538  Transketolase central region  27.09 
 
 		 681 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.244278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  27.37 
 
 		 702 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  33.72 
 
 		 325 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  30.81 
 
 		 325 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  32.09 
 
 		 325 aa  154  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  32.08 
 
 		 326 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  35.74 
 
 		 328 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  34.31 
 
 		 320 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  31.58 
 
 		 339 aa  154  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  24.79 
 
 		 668 aa  154  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  33.14 
 
 		 326 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1926  transketolase, central region  31.78 
 
 		 325 aa  153  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  32.44 
 
 		 326 aa  152  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.8 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  29.8 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.8 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.8 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.39 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  29.8 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.8 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.8 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  31.76 
 
 		 325 aa  151  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  35.11 
 
 		 338 aa  151  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  29.8 
 
 		 325 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  29.6 
 
 		 325 aa  150  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.63 
 
 		 324 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  35.2 
 
 		 347 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  35.2 
 
 		 347 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  31.78 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  29.89 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  36.14 
 
 		 345 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  33.43 
 
 		 320 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  32.39 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  32.39 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  32.39 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  33.63 
 
 		 324 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  33.63 
 
 		 324 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  35.95 
 
 		 327 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  34.6 
 
 		 346 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  33.43 
 
 		 324 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  37.5 
 
 		 337 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  34.6 
 
 		 346 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  29.65 
 
 		 325 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  34.6 
 
 		 346 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  25.48 
 
 		 659 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.6 
 
 		 346 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  31.46 
 
 		 325 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  32.69 
 
 		 342 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  31.15 
 
 		 325 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  31.15 
 
 		 325 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  31.15 
 
 		 325 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  32.83 
 
 		 336 aa  148  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  31.15 
 
 		 325 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.44 
 
 		 341 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  32.95 
 
 		 327 aa  147  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  32.08 
 
 		 325 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  33.24 
 
 		 337 aa  147  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  26.86 
 
 		 659 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  32.35 
 
 		 327 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  31.78 
 
 		 326 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  35.64 
 
 		 325 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  35.41 
 
 		 327 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  32.84 
 
 		 324 aa  145  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>