248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2697 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2697  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  100 
 
 		 421 aa  805    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  45.89 
 
 		 413 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1068  Na+ dependent nucleoside transporter  47.28 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17440  Concentrative nucleoside transporter, CNT family  47.14 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.297043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5279  hypothetical protein  43.17 
 
 		 416 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2461  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.65 
 
 		 416 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3229  Na+ dependent nucleoside transporter  43.78 
 
 		 416 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2232  Na+ dependent nucleoside transporter-like  43.3 
 
 		 416 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.363094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3167  Na+ dependent nucleoside transporter-like  42.86 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.726241  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3336  Na+ dependent nucleoside transporter  44.12 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0272  NupC family nucleoside transporters permease  46.52 
 
 		 413 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2383  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.18 
 
 		 411 aa  325  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0875  Na+ dependent nucleoside transporter  43.41 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0958  Na+ dependent nucleoside transporter  43.06 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.365704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1626  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.99 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0307  Na+ dependent nucleoside transporter  41.59 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.75 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  35.66 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  35.87 
 
 		 414 aa  219  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  33.49 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  35.24 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  31.34 
 
 		 475 aa  216  9e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  32.53 
 
 		 417 aa  216  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  34.6 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  34.05 
 
 		 408 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  33.73 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  32.56 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  34.53 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  32.45 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  30.04 
 
 		 585 aa  206  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  33.49 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  35.58 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  32.78 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  32.95 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  30.93 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  33.25 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  31.47 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  32.69 
 
 		 403 aa  196  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  30.84 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  31.8 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  31.94 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  30.12 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  33.33 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  31.76 
 
 		 427 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  31.19 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  31.02 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  31.07 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  29.57 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  32.28 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  32.56 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  33.1 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  31.53 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  31.97 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  31.26 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  29.16 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  31.59 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  30.99 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  30.9 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  30.66 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  30.2 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  31.43 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  30.77 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  29.91 
 
 		 459 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  30.66 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  29.95 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  32.08 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  33.09 
 
 		 416 aa  183  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  31.19 
 
 		 416 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  31.19 
 
 		 416 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  30.59 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  31.15 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  31.19 
 
 		 416 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  29.71 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  30.54 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  30.09 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  29.71 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  30.09 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  29.71 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  30.3 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  32.84 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  30.3 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  30.17 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  31.55 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  30.3 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  30.95 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  30.95 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  30.3 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  30.83 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  28.3 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  29.79 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  29.46 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  31.73 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  30.34 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  31.33 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  30.33 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  30.19 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  30.56 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  30.54 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  30.19 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  30.54 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>