More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1413 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  100 
 
 		 423 aa  842    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  46.08 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  39.3 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  40.74 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  39.95 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  41.67 
 
 		 426 aa  279  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  40.56 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  41.75 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  41.95 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  42.68 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  42.69 
 
 		 438 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  38.41 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  41.47 
 
 		 459 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  41.57 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  39.01 
 
 		 407 aa  259  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  40.46 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  39.06 
 
 		 430 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  37.18 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  38.14 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  39.45 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  36.63 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  38.46 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.85 
 
 		 426 aa  242  7e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  38.05 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  37.65 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  37.53 
 
 		 426 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  36.99 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  39.11 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  38.89 
 
 		 429 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  38.04 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  40.82 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  37.07 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  37.07 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  36.43 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  36.99 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  37.07 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  39.13 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  37.63 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  36.69 
 
 		 419 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  36.24 
 
 		 407 aa  209  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  35.06 
 
 		 428 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  36.62 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  36.04 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  35.64 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  35.64 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  35.64 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.66 
 
 		 470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  37.64 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.1 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  35.28 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  35.19 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  34.44 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  33.17 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  34.85 
 
 		 407 aa  186  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  34.94 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.25 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  35.84 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  35.64 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  36.41 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  33.67 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  34.93 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  34.02 
 
 		 420 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  34.13 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  32.75 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 		 443 aa  169  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.93 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  34.09 
 
 		 413 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  31.78 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  34.86 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  34.09 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.08 
 
 		 413 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  34.15 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.31 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  33.07 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  34.15 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.66 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  33.83 
 
 		 412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  34.86 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  33.59 
 
 		 431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  34.54 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  33.86 
 
 		 432 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  32.8 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.99 
 
 		 408 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.29 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.14 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.2 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  34.05 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.7 
 
 		 415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  33.67 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  33.33 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  30.73 
 
 		 401 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  33.08 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  31 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  28.96 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  32.93 
 
 		 417 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  34.23 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  34.58 
 
 		 408 aa  150  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  32.41 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  29.16 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>