50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0787 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  100 
 
 		 135 aa  261  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  53.06 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  52.08 
 
 		 109 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  44.33 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  46.24 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  43.33 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  45.05 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  44.21 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  44.21 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  46.59 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  36.84 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  45.45 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  42.22 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  45.45 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  32.69 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  34.69 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  33.67 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  33.67 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  33.7 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  38.95 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  33.7 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  31.63 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  37.63 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  33.33 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  33.33 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  32.26 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  32.26 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  32.26 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  28.16 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  29.73 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.9 
 
 		 475 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  37.8 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  30.61 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.26 
 
 		 358 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  35.71 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 358 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  36.05 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  36.78 
 
 		 419 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 358 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  28.72 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  38.2 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  31.4 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  27.55 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  29.13 
 
 		 373 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 379 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  32.99 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  28.12 
 
 		 386 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2346  Chorismate mutase  31.25 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  25.56 
 
 		 648 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.76 
 
 		 360 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>