50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1957 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  48.8 
 
 		 343 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  40.68 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  40.63 
 
 		 337 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  40.63 
 
 		 337 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  33.25 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  32.46 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  30.52 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  32.51 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  28.27 
 
 		 389 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  30.83 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  29.53 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  27.63 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  30.12 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  30.97 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  28.01 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  29.79 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  26.77 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  28.08 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  24.36 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  27.75 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  30.27 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  27.76 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  28.24 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  27.52 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  29.31 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  29.67 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  28.11 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  30.68 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  28.91 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  28.44 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  30.47 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  28.57 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  29.53 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  27.11 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  28.85 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  29.08 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  25.82 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  27.21 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.52 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  26.5 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5102  hypothetical protein  59.65 
 
 		 60 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  26.79 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  24.17 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  23.46 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  24.62 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  25.25 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  24.26 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  30.91 
 
 		 119 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  25.49 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>