247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1515 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1515  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 342 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.36 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  31.1 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.57 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.93 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  34.31 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  33.23 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.2 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  34.12 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  33.14 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  29.15 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  34.08 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.59 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.26 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.62 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  31.93 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.72 
 
 		 351 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.38 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.65 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.17 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.8 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  34.95 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.78 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  28.21 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.51 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  27.84 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.95 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.38 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.29 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  34.64 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.95 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  28.73 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.69 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  28.73 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  28.24 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  32.14 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  28.65 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.33 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.27 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  32.35 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  33.61 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  34.35 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  31.61 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.59 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  34.64 
 
 		 372 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.37 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.64 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  32.29 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  34.36 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  27.65 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.9 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  32.78 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  32.67 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.46 
 
 		 351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  32.77 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  28.69 
 
 		 364 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.42 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  31.52 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.17 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  28.33 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  30.92 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  32.68 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  28.81 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>