More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0405 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0405  ABC transporter related  100 
 
 
270 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1439  ABC transporter related protein  50.38 
 
 
299 aa  270  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2474  ABC transporter related  57.85 
 
 
299 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471366  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2353  ABC transporter related  54.26 
 
 
309 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.341379  normal  0.122242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  50.79 
 
 
294 aa  255  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3594  ABC transporter related  56.03 
 
 
299 aa  249  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1793  ABC transporter-like protein  47.71 
 
 
270 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1953  ABC transporter related protein  47.15 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00018631  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  42.37 
 
 
334 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  41.28 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.04 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.25 
 
 
308 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 
330 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.67 
 
 
334 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
308 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0377  ABC transporter related  40.09 
 
 
309 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.05 
 
 
333 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  36.21 
 
 
330 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.67 
 
 
305 aa  165  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.27 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  37.9 
 
 
257 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.94 
 
 
338 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.21 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.33 
 
 
338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.33 
 
 
325 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  34.78 
 
 
243 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.18 
 
 
243 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 
321 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 
368 aa  161  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  39.64 
 
 
305 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  36.67 
 
 
332 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.86 
 
 
325 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
330 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.75 
 
 
312 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
280 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  34.91 
 
 
281 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.7 
 
 
314 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.59 
 
 
319 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
309 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.23 
 
 
321 aa  158  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 
338 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  37.92 
 
 
338 aa  158  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
329 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 
280 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  38.03 
 
 
287 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  38.43 
 
 
328 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
301 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 
337 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.72 
 
 
325 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  38.33 
 
 
340 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 
308 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.36 
 
 
309 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.55 
 
 
411 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
280 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
327 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.16 
 
 
327 aa  156  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.81 
 
 
334 aa  156  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.39 
 
 
322 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.09 
 
 
328 aa  155  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  33.33 
 
 
260 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.35 
 
 
741 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
280 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.23 
 
 
324 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.04 
 
 
335 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  42.79 
 
 
307 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
285 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 
317 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 
316 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 
317 aa  153  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
318 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  34.76 
 
 
280 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  36.06 
 
 
317 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  39.73 
 
 
291 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  36.6 
 
 
282 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
343 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.48 
 
 
310 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  36.05 
 
 
301 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.75 
 
 
374 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  41.23 
 
 
312 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  35.29 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  36.15 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.79 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.57 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4966  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
280 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000075672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4984  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
280 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201825  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  36.99 
 
 
315 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  35.48 
 
 
512 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5375  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
280 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 
331 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
251 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.65 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  33.94 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  36.68 
 
 
585 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.41 
 
 
328 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.82 
 
 
311 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 
345 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 
339 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.08 
 
 
347 aa  151  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>