183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0357 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  100 
 
 		 454 aa  889    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  43.49 
 
 		 467 aa  266  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  40.05 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  31.24 
 
 		 451 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  32.28 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 		 501 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7947  MmgE/PrpD family protein  34.99 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  30.52 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  32.56 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  30.36 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  30.18 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30.77 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  26.37 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  31.72 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  30.36 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.66 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  29.31 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.52 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  30.87 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.25 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  35.09 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  30.96 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  28.96 
 
 		 469 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  30.71 
 
 		 450 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  31.65 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  30.94 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  32.51 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  32.45 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29.72 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29.32 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  33.83 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  32.44 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.79 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.05 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30.79 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  29.51 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  31.45 
 
 		 503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.18 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  30.87 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  33.53 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.08 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  31.45 
 
 		 503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  33.53 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  32.49 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.03 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  32.33 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.27 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  32.56 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  29.9 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.05 
 
 		 460 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.16 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  32.91 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  26.38 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  30.1 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  29.46 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  30.86 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  32.6 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  30.48 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  30.03 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.59 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  27.89 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  29.15 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  29.49 
 
 		 434 aa  99.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0800  MmgE/PrpD family protein  31.18 
 
 		 444 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.453247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  29.44 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  29.16 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  28.24 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.9 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  29.24 
 
 		 458 aa  98.2  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  27.89 
 
 		 481 aa  97.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  24.28 
 
 		 481 aa  97.1  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.34 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  26.88 
 
 		 460 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  31.25 
 
 		 494 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  28.4 
 
 		 443 aa  96.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.56 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  29.19 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  31.32 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  27.08 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  27.08 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  30.55 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.14 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  27.08 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  30.02 
 
 		 505 aa  94.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.87 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  23.91 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.13 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  26.54 
 
 		 492 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  26.54 
 
 		 492 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  26.54 
 
 		 492 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  26.54 
 
 		 492 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  31.84 
 
 		 456 aa  90.9  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.07 
 
 		 462 aa  90.5  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 		 456 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  27.16 
 
 		 450 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>