More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3627 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  879    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5959  cytochrome P450  41.46 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0244226 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3674  cytochrome P450  36.45 
 
 		 576 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2436  cytochrome P450  36.21 
 
 		 576 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8744  hypothetical protein  40.57 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0387  cytochrome P450  39.7 
 
 		 427 aa  242  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0770659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3578  hypothetical protein  29 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  29.46 
 
 		 1489 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  29.41 
 
 		 1486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  27.02 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  26.65 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  25.48 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  27.5 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  25.48 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  25.4 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  27.39 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  25.06 
 
 		 1443 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  25.53 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  31.44 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  25.52 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  27.74 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  27.51 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  28.84 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  25.26 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  28.79 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  25.26 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  28.41 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  28.32 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  25.14 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  28.62 
 
 		 938 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  27.61 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  27.11 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  26.57 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  27.46 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  27.82 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  25.57 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4282  cytochrome P450  29.81 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  29.12 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1763  cytochrome P450  27.93 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  26.26 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  30.38 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  26.43 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  28.29 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  29.51 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  25.28 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  26.92 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  27.61 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  28.67 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  29.93 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  24.52 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  27.68 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  26.74 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  28.24 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  31.82 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  28.27 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  26.55 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  27.61 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  27.83 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  27.72 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  26.62 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  27.64 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4984  cytochrome P450  29.01 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  27.9 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  26.67 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  25.59 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  26.48 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  25.25 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  32.87 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  26.11 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  23.63 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  24.91 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  25.77 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  25.27 
 
 		 780 aa  69.7  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  27.49 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  25.17 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  23.13 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  25.05 
 
 		 783 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  24.56 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  28.32 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  24.91 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  23.13 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  29.23 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  24.04 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  26.53 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  28.23 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3420  cytochrome P450  26.56 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00557634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  28.24 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  23.13 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  26.85 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  25.53 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  26.37 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05028  Fatty acid oxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6IYE5]  29.11 
 
 		 1117 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.446409  normal  0.730918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  25.94 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  23.57 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0950  cytochrome P450  33.33 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178452  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01967  Fatty acid oxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6RET3]  22.11 
 
 		 1081 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.990808  normal  0.262225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  27.86 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  22.57 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  27.49 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  30.7 
 
 		 774 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>