More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2020 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  99.56 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  84.44 
 
 		 225 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  59.91 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  56.44 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  52.4 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  49.11 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  51.18 
 
 		 236 aa  204  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  43.75 
 
 		 243 aa  175  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  40.34 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  40.65 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  41.42 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  37 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  40.59 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.34 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  40.59 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  38.36 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  36.96 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  33.62 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  32.62 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  35.34 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  31 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  32.33 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  32.33 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  37.07 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  31.65 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  33 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  33.16 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  33.67 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  30.47 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  30.47 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  31.84 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  29.83 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  26.41 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  28.9 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  30.43 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  30.11 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.02 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  35.81 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  31.09 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  28.91 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  28.5 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  27.5 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.56 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  30.64 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  29.56 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  32.16 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.08 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  26.47 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  31.36 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  31.79 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.56 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  29.84 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  34.07 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  29.51 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  25.91 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  27.08 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  29.31 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  29.55 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  22.28 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.95 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  28.98 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  26.52 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  29.29 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  27.32 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  31.85 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  28 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  24.03 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  30.29 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  27.85 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  31.34 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  32.43 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  29.12 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  30.83 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  30.32 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  27.36 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  34.35 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  25.74 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  28.17 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  32.65 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  30.34 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  32.7 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.5 
 
 		 536 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  28.07 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  32.64 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  30.18 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  33.58 
 
 		 517 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>