46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1407 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  96.95 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  83.21 
 
 		 131 aa  228  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  45.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  47.69 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  36.92 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  35.82 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  37.41 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  34.88 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  34.13 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  34.11 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  36.97 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  33.08 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  31.01 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  30.22 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  35.59 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  35.59 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  35.59 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  28.12 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  30.89 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  30.71 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  29.23 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  30.23 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  29.92 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  30.23 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  27.69 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  35.14 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  39.71 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  38.03 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  25.56 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  39.62 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  28.57 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>