86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4344 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  100 
 
 		 734 aa  1431    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  40.91 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  44.18 
 
 		 686 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  39.22 
 
 		 518 aa  183  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  40.52 
 
 		 521 aa  181  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  40.95 
 
 		 514 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  38.96 
 
 		 521 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  36.3 
 
 		 521 aa  178  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  37.21 
 
 		 544 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  38.49 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  41.26 
 
 		 401 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  39.02 
 
 		 585 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  30.79 
 
 		 522 aa  171  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  36.72 
 
 		 551 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  37.5 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  39.51 
 
 		 660 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  38.79 
 
 		 512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  40.85 
 
 		 599 aa  164  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  35.96 
 
 		 569 aa  163  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  36.78 
 
 		 1117 aa  163  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  35.56 
 
 		 522 aa  163  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  39.78 
 
 		 405 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  35.9 
 
 		 724 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  36.02 
 
 		 596 aa  154  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  34.66 
 
 		 585 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  37.61 
 
 		 405 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  35.2 
 
 		 821 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  36.29 
 
 		 514 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  35.5 
 
 		 402 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  35.6 
 
 		 649 aa  124  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  34.92 
 
 		 470 aa  120  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  32.8 
 
 		 697 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  34.92 
 
 		 465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  35.36 
 
 		 522 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  31.67 
 
 		 690 aa  111  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  32.42 
 
 		 542 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  31.34 
 
 		 524 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  29.1 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.12 
 
 		 700 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  33.16 
 
 		 802 aa  108  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  30.29 
 
 		 781 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  32.64 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  34.25 
 
 		 644 aa  105  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  32.62 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  30.89 
 
 		 478 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  32.26 
 
 		 497 aa  96.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  33.51 
 
 		 498 aa  96.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  33.7 
 
 		 517 aa  95.9  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  31.02 
 
 		 479 aa  95.5  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  33.52 
 
 		 522 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  31.05 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  30.56 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  31.05 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.89 
 
 		 740 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  28 
 
 		 740 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  25.37 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  25.61 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  24.88 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  24.88 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  27.47 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  26.79 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  25.11 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  26.25 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.77 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  28.27 
 
 		 400 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.77 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  28.25 
 
 		 396 aa  54.3  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  27.01 
 
 		 392 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  26.86 
 
 		 391 aa  51.2  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  23.6 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  26.46 
 
 		 388 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  32.31 
 
 		 534 aa  48.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  28.26 
 
 		 391 aa  47.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.66 
 
 		 388 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  24.26 
 
 		 386 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  24.73 
 
 		 387 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  26.11 
 
 		 395 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  28.3 
 
 		 386 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  23.75 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  24.34 
 
 		 485 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  35.83 
 
 		 747 aa  44.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  24.59 
 
 		 388 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  23.2 
 
 		 397 aa  44.3  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  23.2 
 
 		 397 aa  44.3  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  22.89 
 
 		 475 aa  44.3  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  22.89 
 
 		 475 aa  43.9  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>