More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0880 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  85.34 
 
 		 307 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  85.34 
 
 		 307 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  44.7 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  43.28 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  47.44 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.68 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  43.43 
 
 		 296 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  37.46 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  40.96 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  36.49 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.82 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.88 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  36.73 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  36.39 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.3 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33.22 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.53 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.79 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.09 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.88 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  32.29 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.94 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  33.22 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.34 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.12 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  32.18 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.24 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 339 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  32.16 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  30.43 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  30.19 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30.1 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  29.55 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.8 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  29.55 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  31.6 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.21 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  28.97 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  31.32 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  31.32 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.46 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  30.46 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.03 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  31.8 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  31.34 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  31.99 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  30.17 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  30.6 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.97 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  30.58 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.08 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  31.62 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.73 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  31.86 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  27.83 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  29.97 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  30.33 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  30.1 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.86 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.87 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  29.24 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.57 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  29.9 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  28.38 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  29.89 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  28.9 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.29 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  29.49 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  29.21 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  30.67 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  29.97 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  29.29 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  29.97 
 
 		 303 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.75 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  29.41 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  27.76 
 
 		 305 aa  85.9  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  26.26 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  27.33 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  28.38 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  28.82 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  28.82 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  29.67 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>