More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0840 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2262  DNA primase  57.36 
 
 		 650 aa  686    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.9199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  79.71 
 
 		 643 aa  956    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  57.93 
 
 		 646 aa  665    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  54.93 
 
 		 669 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2050  DNA primase  79.05 
 
 		 643 aa  948    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.279269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0840  DNA primase  100 
 
 		 654 aa  1302    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  57.74 
 
 		 646 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  47.13 
 
 		 639 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  42.27 
 
 		 655 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  42.43 
 
 		 681 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  44.86 
 
 		 656 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  43.81 
 
 		 646 aa  435  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  44.59 
 
 		 671 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  43.12 
 
 		 669 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  40.13 
 
 		 678 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  43.96 
 
 		 666 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  47.24 
 
 		 627 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  44.7 
 
 		 629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  41 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  46.08 
 
 		 629 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  49.88 
 
 		 642 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  48.01 
 
 		 633 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  45.97 
 
 		 641 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  45.12 
 
 		 641 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  50.96 
 
 		 639 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  50.24 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  50.12 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  41.15 
 
 		 665 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  43.45 
 
 		 623 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  47.45 
 
 		 625 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  48.19 
 
 		 671 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  41.08 
 
 		 683 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  43.31 
 
 		 621 aa  361  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  41.11 
 
 		 685 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  46.57 
 
 		 669 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  44.42 
 
 		 620 aa  349  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2130  DNA primase  44.2 
 
 		 613 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.281855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  40.25 
 
 		 634 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  41.55 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  42.48 
 
 		 639 aa  304  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  39.64 
 
 		 619 aa  299  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  40.76 
 
 		 613 aa  296  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  38.98 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0861  DNA primase  44.81 
 
 		 609 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  42.25 
 
 		 645 aa  292  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  43.43 
 
 		 656 aa  291  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  43.19 
 
 		 660 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  42.04 
 
 		 652 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.67 
 
 		 660 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  42.71 
 
 		 655 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  42.63 
 
 		 660 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.41 
 
 		 660 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  41.51 
 
 		 651 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  42.45 
 
 		 638 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.36 
 
 		 663 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.79 
 
 		 666 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.36 
 
 		 664 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  39.58 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  41.86 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  40.63 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  41.65 
 
 		 652 aa  278  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  38.19 
 
 		 584 aa  276  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2708  DNA primase  41.2 
 
 		 549 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  38.48 
 
 		 617 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  39.66 
 
 		 579 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  38.98 
 
 		 574 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  38.98 
 
 		 574 aa  274  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  39.52 
 
 		 575 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.19 
 
 		 599 aa  273  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  38.3 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  38.3 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  38.74 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  38.3 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  38.3 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  37.83 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  38.3 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  38.74 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  38.3 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  37.59 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  35.02 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  35.02 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  37.71 
 
 		 584 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  40.05 
 
 		 592 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  35.02 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  41.38 
 
 		 622 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  39.13 
 
 		 575 aa  272  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  35.02 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  39.59 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  41.28 
 
 		 623 aa  271  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  37.47 
 
 		 582 aa  271  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  37.56 
 
 		 576 aa  270  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  38.31 
 
 		 573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  37.53 
 
 		 584 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  38.06 
 
 		 581 aa  270  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  38.06 
 
 		 581 aa  270  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  33.6 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  269  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  43.66 
 
 		 631 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  269  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  269  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>