More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0653 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  291  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  96.71 
 
 
152 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  95.39 
 
 
152 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  82.89 
 
 
152 aa  250  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  82.31 
 
 
153 aa  240  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  78.95 
 
 
152 aa  239  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  78.81 
 
 
151 aa  237  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
156 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 
159 aa  114  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.22 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  43.62 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.26 
 
 
156 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
156 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  38 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
156 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  38 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
156 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
174 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
159 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  45.24 
 
 
157 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.67 
 
 
156 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
163 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
155 aa  103  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
155 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
156 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
181 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
163 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
181 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
163 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
154 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
158 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
181 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
154 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
154 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
163 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
181 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
174 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
157 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
153 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
158 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
168 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 
163 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 
172 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
154 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
154 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2302  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
151 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
161 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
161 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
161 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
161 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
180 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
161 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
161 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
161 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  42.97 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  35.14 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2395  transcriptional regulator  40.69 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  35.81 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
153 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1239  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.677106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0652  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  97.1  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>