111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0427 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  322  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  78.88 
 
 
161 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  78.88 
 
 
161 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  44.94 
 
 
318 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  43.87 
 
 
314 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.87 
 
 
312 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  43.87 
 
 
307 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  43.87 
 
 
308 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
316 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
315 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
163 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
305 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.71 
 
 
320 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.79 
 
 
304 aa  121  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.88 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
314 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.11 
 
 
310 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.61 
 
 
326 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
309 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
162 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
309 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
310 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.58 
 
 
305 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.24 
 
 
305 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
308 aa  97.1  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
307 aa  94  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 
308 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
306 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  29.61 
 
 
848 aa  87.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.52 
 
 
311 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.55 
 
 
317 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
310 aa  81.3  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
321 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  33.1 
 
 
313 aa  68.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
326 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
326 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
336 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
329 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
321 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
326 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
326 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
326 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
325 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.17 
 
 
325 aa  57.4  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1410  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01922  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.57 
 
 
74 aa  50.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0828281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
293 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3079  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
287 aa  48.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1561  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.31 
 
 
291 aa  47.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381847  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  39.02 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  25.88 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  30.77 
 
 
380 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  25.88 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0052  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  25.88 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  25.88 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  39.02 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1835  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0223571  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0313  hypothetical protein  31.91 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  25.55 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2440  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.102944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  27.88 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2434  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
196 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2033  acetyltransferase  28.57 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.832186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5735  hypothetical protein  34.18 
 
 
290 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.18 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.1 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3914  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
281 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
1031 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  32.14 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1453  acetyltransferase  24.39 
 
 
155 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  27.22 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.41 
 
 
156 aa  42  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
882 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4378  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
263 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  25.41 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>