204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2535 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  100 
 
 		 551 aa  1071    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  32.84 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0708  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.91 
 
 		 571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.208024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0867  flagellar hook-associated 2-like  30.98 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0761  flagellar hook-associated protein  31.21 
 
 		 559 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  31.94 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.2 
 
 		 456 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.81 
 
 		 454 aa  133  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.45 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  32.71 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 451 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.16 
 
 		 456 aa  124  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.07 
 
 		 456 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  32.67 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 457 aa  113  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.96 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.9 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.81 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  28.81 
 
 		 668 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.79 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.02 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.35 
 
 		 543 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  27.83 
 
 		 781 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.72 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  30.79 
 
 		 472 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.47 
 
 		 458 aa  100  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  32.73 
 
 		 669 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.44 
 
 		 468 aa  98.2  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28.98 
 
 		 474 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  30.73 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  29.41 
 
 		 677 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  26.84 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.73 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  26.2 
 
 		 541 aa  93.6  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  32.25 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  30.25 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  30.25 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  29.56 
 
 		 466 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  29.09 
 
 		 474 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  28.68 
 
 		 478 aa  91.3  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  27.38 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 465 aa  90.5  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  29.56 
 
 		 466 aa  90.5  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.61 
 
 		 447 aa  90.5  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  26.34 
 
 		 541 aa  90.1  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  29.21 
 
 		 458 aa  90.1  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  27.25 
 
 		 502 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.25 
 
 		 502 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 487 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.32 
 
 		 502 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.95 
 
 		 452 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  29.31 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  27.07 
 
 		 445 aa  87.4  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.61 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.24 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.99 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  29.92 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.27 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  28.11 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.14 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  28.89 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.07 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.27 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  28.81 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  28.81 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  25.12 
 
 		 507 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  25.12 
 
 		 507 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  25.36 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  28.81 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.97 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.67 
 
 		 472 aa  76.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  25.12 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  25.12 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  25.12 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  25.12 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  30.5 
 
 		 665 aa  74.7  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  24.88 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.37 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  30.8 
 
 		 632 aa  73.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.44 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.07 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  25.28 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.17 
 
 		 554 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  27.59 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  29.89 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.56 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2560  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.19 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.82 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  28.19 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1659  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.65 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.86 
 
 		 678 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.86 
 
 		 678 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>