More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2445 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  757    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  60.73 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1228  protein of unknown function DUF140  48.68 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  43.21 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  43.24 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  39.73 
 
 		 370 aa  232  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  41.11 
 
 		 369 aa  229  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  41.3 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  40.43 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  40.8 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  38.36 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  31.81 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  42.74 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  35.37 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  33.07 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  33.08 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  36.81 
 
 		 380 aa  182  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  29.29 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  35.73 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  34.6 
 
 		 381 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  34.6 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  33.51 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.25 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.16 
 
 		 372 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  34.53 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  34.05 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  38.25 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  32.71 
 
 		 384 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  30.35 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  36.29 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  32.65 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  30.69 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  30.69 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  30.7 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  33.25 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  34.46 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 377 aa  166  8e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  30.79 
 
 		 368 aa  166  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1711  hypothetical protein  36.46 
 
 		 369 aa  166  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000795041 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  35.64 
 
 		 377 aa  166  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  39.46 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  39.77 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  34.45 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.47 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  34.2 
 
 		 374 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  33.16 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  33.53 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  35.01 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  33.75 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  34.53 
 
 		 377 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  32.47 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  34.48 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  35.07 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  39.64 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  41.06 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  42.47 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  31.42 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  40.49 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  30.77 
 
 		 447 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  36.59 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31.42 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  36.64 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  42.91 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  40.09 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  33.08 
 
 		 373 aa  155  8e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  35.19 
 
 		 376 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  42.21 
 
 		 379 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  31.12 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  30.55 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  39.19 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  34.06 
 
 		 474 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  31.08 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  39.81 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  39.53 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.55 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  39.05 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  28.53 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  29.39 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  32.85 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  32.27 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  39.62 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  39.62 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  31.09 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  31.27 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  32.22 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  28.3 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  28.3 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  29.59 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  29.35 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  35.1 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  38.1 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  29.97 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0174  ABC transporter, permease protein, putative  31.41 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  29.79 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  33.72 
 
 		 378 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  30.51 
 
 		 425 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  34.48 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>