More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0894 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  96.34 
 
 		 246 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  83.33 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  59.43 
 
 		 272 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  57.09 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 249 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  33.75 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 258 aa  151  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  34.05 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  29.88 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  29.87 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  30.45 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  28.74 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  31.13 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.32 
 
 		 705 aa  72.4  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.7 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1189  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169392  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  28.4 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.27 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0464631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  27.63 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.53 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.85 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  25 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0055984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.92 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.9 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.95482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.013763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.38 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.33 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.538223  normal  0.0864217 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  25.89 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.85 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 226 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0044  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  24.5 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.170136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.27 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.89 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.77 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25521  predicted protein  27.18 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1629  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.77 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>