More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4021 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 269 aa  553  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 269 aa  553  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  69.58 
 
 		 272 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  69.11 
 
 		 281 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  67.29 
 
 		 276 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  70.27 
 
 		 270 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  68.06 
 
 		 267 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  69.5 
 
 		 270 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  67.05 
 
 		 270 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  71.04 
 
 		 270 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  70.66 
 
 		 270 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  65.79 
 
 		 271 aa  352  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  69.88 
 
 		 270 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  69.88 
 
 		 270 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  45.27 
 
 		 286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  48.96 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  44.92 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 425 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  33 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  33 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  29.18 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.13 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  28.74 
 
 		 296 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  28.74 
 
 		 296 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  28.74 
 
 		 296 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.59 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.69 
 
 		 296 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.74 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.38 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.94 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  30.83 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 323 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  30.83 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 220 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  26.5 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  25.41 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  33.04 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  33.04 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  27.44 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.52 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  26.85 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  30.23 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.8 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.51 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  22.05 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.08 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  26.32 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  23.89 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>