More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4011 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  83.59 
 
 		 459 aa  797    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  80.74 
 
 		 459 aa  774    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  66.3 
 
 		 459 aa  648    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  82.06 
 
 		 459 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  80.22 
 
 		 459 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  81.18 
 
 		 458 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  81.4 
 
 		 459 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  63.68 
 
 		 458 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  80.31 
 
 		 459 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  81.62 
 
 		 590 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  100 
 
 		 459 aa  930    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  77.8 
 
 		 459 aa  716    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  67.61 
 
 		 459 aa  666    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  100 
 
 		 459 aa  930    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  81.62 
 
 		 459 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  81.4 
 
 		 459 aa  782    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  82.06 
 
 		 458 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  81.62 
 
 		 459 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  66.52 
 
 		 458 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  67.03 
 
 		 460 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  66.37 
 
 		 457 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  65.2 
 
 		 459 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  65.2 
 
 		 459 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  65.2 
 
 		 459 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  61.93 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  59.56 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  59.43 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  55.01 
 
 		 467 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  54.92 
 
 		 455 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  54.07 
 
 		 453 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  54.27 
 
 		 466 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  52.99 
 
 		 466 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.11 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  38.13 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  37.69 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.15 
 
 		 456 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.13 
 
 		 460 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  43.29 
 
 		 473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.76 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40 
 
 		 466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.72 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.89 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  37.34 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.44 
 
 		 459 aa  306  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  37.12 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.45 
 
 		 459 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.98 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.98 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.85 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.85 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.67 
 
 		 432 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.74 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.58 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.26 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.53 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.53 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.53 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.19 
 
 		 458 aa  262  8.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.09 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.93 
 
 		 441 aa  259  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.15 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  35.1 
 
 		 507 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.93 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  34.72 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.72 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.72 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.5 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  34.5 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  36.08 
 
 		 557 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 		 449 aa  249  9e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.35 
 
 		 462 aa  249  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.18 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.58 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  35.98 
 
 		 505 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  34.65 
 
 		 510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  32.96 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.05 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 474 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  31.49 
 
 		 468 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  33.11 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  31.85 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.98 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.23 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.4 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 		 476 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.07 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  34.81 
 
 		 525 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.62 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 		 471 aa  232  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 		 476 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  31.96 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>