130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1411 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  100 
 
 		 367 aa  758    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  83.11 
 
 		 367 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  94.82 
 
 		 367 aa  725    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  81.2 
 
 		 367 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  45.16 
 
 		 385 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  44.35 
 
 		 385 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  37.67 
 
 		 369 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  38.34 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  38.24 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  38.07 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.34 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  37.27 
 
 		 374 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  36.24 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.89 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.89 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.89 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  36.44 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.44 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.44 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  31.93 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  32.11 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  31.32 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  31.32 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  31.32 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  30.48 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.17 
 
 		 937 aa  69.7  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  29.9 
 
 		 1498 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  29.84 
 
 		 1436 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  26.34 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  27.8 
 
 		 1485 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  28.12 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  28.84 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  28.84 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  29.45 
 
 		 701 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  28.46 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  27.24 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.84 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  29.43 
 
 		 1421 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  27.65 
 
 		 1506 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.74 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.8 
 
 		 322 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 355 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.46 
 
 		 304 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  27.03 
 
 		 1500 aa  52.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.99 
 
 		 1270 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  28.29 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  25.1 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05348  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0521089  normal  0.0191103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  25.48 
 
 		 1454 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  27.34 
 
 		 1449 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  27.35 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  29 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  25.4 
 
 		 351 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  22.67 
 
 		 661 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  25.78 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  25.75 
 
 		 1067 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.97 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  25.2 
 
 		 2199 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  26.59 
 
 		 1188 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  26.78 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.47 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  23.69 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.86 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.42 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  27.2 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  26.59 
 
 		 1188 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  26.59 
 
 		 1188 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  27.2 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  26.57 
 
 		 1168 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.32 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 750 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  27.11 
 
 		 2113 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  28.83 
 
 		 4123 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  29.48 
 
 		 4048 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  25.21 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>