48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0063 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  100 
 
 		 862 aa  1788    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  24.54 
 
 		 856 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  24.7 
 
 		 947 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  24.57 
 
 		 947 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  24.57 
 
 		 947 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  23.19 
 
 		 852 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  26.09 
 
 		 953 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  26.01 
 
 		 870 aa  141  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  23.02 
 
 		 893 aa  141  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  26.57 
 
 		 875 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  24.73 
 
 		 880 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  23.04 
 
 		 858 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  23.04 
 
 		 858 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  25.57 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0059  hypothetical protein  86.79 
 
 		 60 aa  101  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  23.89 
 
 		 832 aa  92.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0061  hypothetical protein  79.25 
 
 		 60 aa  88.6  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  31.87 
 
 		 966 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  23.97 
 
 		 945 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1160 aa  80.5  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  24.17 
 
 		 944 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1007 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  31.31 
 
 		 949 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  29.28 
 
 		 945 aa  66.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  29.28 
 
 		 944 aa  66.6  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  29.28 
 
 		 944 aa  66.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  29.28 
 
 		 944 aa  65.1  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1013 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  23.31 
 
 		 887 aa  60.1  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  27.36 
 
 		 925 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2278  hypothetical protein  24.71 
 
 		 631 aa  57  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.262759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1072 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1126 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1082 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1049 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  26.88 
 
 		 960 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3481  hypothetical protein  25.86 
 
 		 671 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.278924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1146 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  21.98 
 
 		 893 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1085 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  20.76 
 
 		 890 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  20.57 
 
 		 890 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  20.57 
 
 		 907 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  30.11 
 
 		 996 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1142 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  29.35 
 
 		 996 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1132 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  26.9 
 
 		 252 aa  45.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>