37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0008 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  100 
 
 
960 aa  1987    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  56.64 
 
 
966 aa  1050    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  40.86 
 
 
949 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  34.93 
 
 
945 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  61.51 
 
 
944 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  30.17 
 
 
1007 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  28.97 
 
 
944 aa  350  8e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  29.46 
 
 
944 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  29.1 
 
 
945 aa  345  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  29.1 
 
 
944 aa  336  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  26.56 
 
 
780 aa  251  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  27.26 
 
 
770 aa  250  9e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00274  hypothetical protein  27.06 
 
 
655 aa  137  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00279  hypothetical protein  28.1 
 
 
376 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  30.15 
 
 
853 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  29.55 
 
 
858 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  29.55 
 
 
858 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  21.85 
 
 
875 aa  88.6  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  33.95 
 
 
892 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  22.85 
 
 
1160 aa  82.8  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01372  hypothetical protein  33.73 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  28.86 
 
 
856 aa  72  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  30.81 
 
 
880 aa  68.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  32.57 
 
 
893 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02165  ISxac3 transposase  34.86 
 
 
171 aa  67.8  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  29.38 
 
 
1049 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  28.87 
 
 
852 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  27.36 
 
 
870 aa  62.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  27.53 
 
 
947 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  27.53 
 
 
947 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  27.53 
 
 
953 aa  62  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  27.69 
 
 
862 aa  62  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  27.53 
 
 
947 aa  62  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  29.73 
 
 
1072 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  29.22 
 
 
1013 aa  58.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  29.05 
 
 
1082 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  31.28 
 
 
925 aa  49.7  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>