41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7020 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  53.56 
 
 
852 aa  891    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  100 
 
 
856 aa  1766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3481  hypothetical protein  47.34 
 
 
671 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.278924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  25.61 
 
 
853 aa  217  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  31.45 
 
 
858 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  31.45 
 
 
858 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  28 
 
 
893 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  24.05 
 
 
880 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  24.97 
 
 
862 aa  168  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  27.1 
 
 
947 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  27.1 
 
 
947 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  27.1 
 
 
947 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  41.97 
 
 
953 aa  138  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  41.97 
 
 
870 aa  137  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  22.96 
 
 
875 aa  119  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2278  hypothetical protein  26.52 
 
 
631 aa  105  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.262759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  33.33 
 
 
945 aa  91.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  27.94 
 
 
1160 aa  88.6  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  31.73 
 
 
966 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  32.51 
 
 
944 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  31.98 
 
 
925 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  28.89 
 
 
949 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  47.14 
 
 
832 aa  71.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  23.87 
 
 
1013 aa  71.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  28.08 
 
 
960 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  30.27 
 
 
944 aa  65.1  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  30.27 
 
 
945 aa  65.1  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  30.27 
 
 
944 aa  64.3  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  19.23 
 
 
1049 aa  64.3  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  28.92 
 
 
1007 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  29.73 
 
 
944 aa  63.9  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  33.61 
 
 
252 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  23.33 
 
 
1072 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  21.3 
 
 
1082 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  22.34 
 
 
890 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  22.38 
 
 
907 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  25.25 
 
 
996 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  24.75 
 
 
996 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  22.34 
 
 
890 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  26.46 
 
 
996 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  23.06 
 
 
890 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>