43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6438 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  100 
 
 		 966 aa  1993    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  56.64 
 
 		 960 aa  1069    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  37.45 
 
 		 949 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  33.83 
 
 		 945 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  59.87 
 
 		 944 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1007 aa  361  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  26.86 
 
 		 944 aa  193  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  27.67 
 
 		 944 aa  190  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  27.12 
 
 		 945 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  27.49 
 
 		 780 aa  183  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  27.31 
 
 		 944 aa  180  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  27.47 
 
 		 770 aa  177  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00274  hypothetical protein  27.4 
 
 		 655 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  28.23 
 
 		 853 aa  92  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  28.23 
 
 		 858 aa  92.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  28.23 
 
 		 858 aa  92.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  31.87 
 
 		 862 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  31.73 
 
 		 856 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  34.25 
 
 		 893 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00279  hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  26.2 
 
 		 875 aa  76.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01372  hypothetical protein  33.73 
 
 		 202 aa  75.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  21.39 
 
 		 887 aa  73.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  33.54 
 
 		 892 aa  73.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02165  ISxac3 transposase  40.57 
 
 		 171 aa  72  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  31.37 
 
 		 852 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1072 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1082 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  29.28 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1160 aa  59.7  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1013 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  29.61 
 
 		 947 aa  55.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  29.61 
 
 		 947 aa  55.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  28.49 
 
 		 947 aa  55.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  26.55 
 
 		 870 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  26.55 
 
 		 953 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  35.19 
 
 		 925 aa  49.7  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  19.16 
 
 		 890 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  26.32 
 
 		 907 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  21.04 
 
 		 893 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  18.99 
 
 		 890 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  19.34 
 
 		 890 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>