34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01956 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  100 
 
 		 925 aa  1910    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  88.06 
 
 		 252 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  21.82 
 
 		 887 aa  87.8  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  31.98 
 
 		 856 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  30.6 
 
 		 853 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  30.6 
 
 		 858 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  30.6 
 
 		 858 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  28.22 
 
 		 947 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  28.22 
 
 		 947 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  28.22 
 
 		 947 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  30.81 
 
 		 893 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  29.69 
 
 		 953 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  29.69 
 
 		 870 aa  68.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  23.21 
 
 		 875 aa  67.8  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1013 aa  64.7  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  23.56 
 
 		 949 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  29.38 
 
 		 852 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  27.81 
 
 		 945 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1072 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  27.36 
 
 		 862 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  32.91 
 
 		 944 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  27.96 
 
 		 944 aa  55.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  30.63 
 
 		 944 aa  55.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  27.49 
 
 		 944 aa  55.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  27.96 
 
 		 945 aa  55.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1160 aa  54.7  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1082 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  25.23 
 
 		 890 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 966 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1007 aa  48.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  23.69 
 
 		 907 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  23.69 
 
 		 890 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  30.17 
 
 		 960 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1049 aa  45.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>