24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2369 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  90.34 
 
 		 890 aa  1536    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  96.85 
 
 		 907 aa  1715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  88.13 
 
 		 893 aa  1543    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  100 
 
 		 890 aa  1825    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  91.69 
 
 		 890 aa  1563    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  27.59 
 
 		 887 aa  281  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.1 
 
 		 875 aa  71.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  22.14 
 
 		 852 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  21.34 
 
 		 893 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  21.23 
 
 		 780 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  21.44 
 
 		 862 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  20.71 
 
 		 949 aa  55.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1007 aa  54.7  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  21.29 
 
 		 945 aa  54.3  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  21.72 
 
 		 944 aa  52.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  21.43 
 
 		 770 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  22.4 
 
 		 856 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  20.49 
 
 		 944 aa  50.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  21.82 
 
 		 944 aa  48.9  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  22.95 
 
 		 925 aa  47.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  27.45 
 
 		 996 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1160 aa  47  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  27.45 
 
 		 996 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  21.97 
 
 		 880 aa  44.3  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>