42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4615 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  88.58 
 
 
853 aa  1568    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  100 
 
 
858 aa  1771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  100 
 
 
858 aa  1771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  31.45 
 
 
856 aa  211  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  23.94 
 
 
852 aa  203  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  24.95 
 
 
893 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.77 
 
 
875 aa  143  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  23.15 
 
 
862 aa  137  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  22.89 
 
 
880 aa  134  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  25.83 
 
 
945 aa  119  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  27.66 
 
 
944 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3481  hypothetical protein  20.59 
 
 
671 aa  108  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.278924 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  32.75 
 
 
947 aa  108  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  32.75 
 
 
947 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  32.75 
 
 
947 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  35.26 
 
 
870 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  35.26 
 
 
953 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  29.55 
 
 
960 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  29.15 
 
 
1007 aa  100  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  28.42 
 
 
949 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  25.74 
 
 
1013 aa  97.8  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  25.05 
 
 
944 aa  92.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  29.02 
 
 
1160 aa  92.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  25.05 
 
 
945 aa  92  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  25.05 
 
 
944 aa  91.7  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  29.25 
 
 
966 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  24.65 
 
 
944 aa  89.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  30.6 
 
 
925 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  25.55 
 
 
1072 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  24.72 
 
 
1082 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  27.39 
 
 
1049 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  27.33 
 
 
252 aa  57  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  23.08 
 
 
832 aa  54.3  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2278  hypothetical protein  19.96 
 
 
631 aa  54.3  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.262759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  24.15 
 
 
996 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  24.15 
 
 
996 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  26.04 
 
 
996 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  25.52 
 
 
996 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  23.19 
 
 
996 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  25.68 
 
 
887 aa  48.1  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  25.25 
 
 
996 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  23.57 
 
 
1085 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>