45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0012 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  100 
 
 
945 aa  1927    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  59.58 
 
 
944 aa  1164    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  33.46 
 
 
1007 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  66.56 
 
 
960 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  30 
 
 
944 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  29.88 
 
 
949 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  29.72 
 
 
945 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  30.31 
 
 
944 aa  376  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  29.32 
 
 
944 aa  376  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  58.57 
 
 
966 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  27.23 
 
 
780 aa  264  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  27.38 
 
 
770 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00274  hypothetical protein  27.82 
 
 
655 aa  230  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00279  hypothetical protein  30.89 
 
 
376 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  25.09 
 
 
853 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  25.83 
 
 
858 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  25.83 
 
 
858 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  25.51 
 
 
1160 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  22.52 
 
 
875 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  25.57 
 
 
947 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  25.09 
 
 
947 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  25.09 
 
 
947 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  25.29 
 
 
893 aa  93.6  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  33.33 
 
 
856 aa  92  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  25.47 
 
 
870 aa  88.2  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 
892 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  25.3 
 
 
953 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  31.12 
 
 
852 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  23.97 
 
 
862 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01372  hypothetical protein  33.15 
 
 
202 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02165  ISxac3 transposase  39.66 
 
 
171 aa  73.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  30.11 
 
 
880 aa  72.8  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  32.08 
 
 
1049 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  23.85 
 
 
1072 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  29.05 
 
 
1082 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  23.23 
 
 
887 aa  65.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  23.08 
 
 
1013 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  27.81 
 
 
925 aa  58.2  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  28.86 
 
 
996 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  28.36 
 
 
996 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  23.81 
 
 
832 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  25.73 
 
 
996 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  26.21 
 
 
996 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  26.83 
 
 
996 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  27.36 
 
 
996 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>