30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3236 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  77.41 
 
 
996 aa  1550    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  100 
 
 
996 aa  2044    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  92.67 
 
 
996 aa  1877    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  87.85 
 
 
996 aa  1776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  87.15 
 
 
996 aa  1771    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  87.05 
 
 
996 aa  1766    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  25.35 
 
 
947 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  25.35 
 
 
947 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  25 
 
 
947 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  29.78 
 
 
1007 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  29.7 
 
 
953 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  23.09 
 
 
875 aa  52.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  24.38 
 
 
852 aa  52.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  29.7 
 
 
870 aa  52  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  26.04 
 
 
853 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  26.91 
 
 
949 aa  49.3  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  25.52 
 
 
858 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  24.51 
 
 
1174 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  25.52 
 
 
858 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  30.11 
 
 
862 aa  48.5  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  25.66 
 
 
890 aa  48.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  24.75 
 
 
856 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  25.73 
 
 
945 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3851  hypothetical protein  26.53 
 
 
1104 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  24.46 
 
 
1160 aa  47.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  25.28 
 
 
893 aa  47.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  27.45 
 
 
907 aa  47  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  27.45 
 
 
890 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  26.47 
 
 
893 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  21.61 
 
 
1461 aa  44.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>