25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2555 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  84.66 
 
 		 890 aa  1449    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  87.68 
 
 		 907 aa  1573    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  100 
 
 		 893 aa  1827    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  88.13 
 
 		 890 aa  1519    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  83.43 
 
 		 890 aa  1429    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  27.96 
 
 		 887 aa  262  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  24.84 
 
 		 875 aa  70.1  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  22.19 
 
 		 949 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1007 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  23.6 
 
 		 852 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  22.27 
 
 		 780 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  22.62 
 
 		 862 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  22.27 
 
 		 893 aa  54.7  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  21.72 
 
 		 770 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  22.07 
 
 		 945 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  20.94 
 
 		 960 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  26.9 
 
 		 944 aa  48.5  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  25.42 
 
 		 945 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  21.93 
 
 		 966 aa  47.8  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1160 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  26.83 
 
 		 944 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  26.47 
 
 		 996 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  26.47 
 
 		 996 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2245  hypothetical protein  37.74 
 
 		 62 aa  45.8  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  26 
 
 		 996 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>