37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2248 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  100 
 
 
1160 aa  2379    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  24.61 
 
 
875 aa  115  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  25.51 
 
 
945 aa  110  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  25 
 
 
949 aa  104  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  32.6 
 
 
953 aa  97.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  31.17 
 
 
893 aa  97.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  32.23 
 
 
870 aa  95.1  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  28.67 
 
 
853 aa  92  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  28.92 
 
 
858 aa  92  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  28.92 
 
 
858 aa  92  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  31.86 
 
 
947 aa  91.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  31.86 
 
 
947 aa  91.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  31.86 
 
 
947 aa  91.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  27.94 
 
 
856 aa  88.6  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  25.87 
 
 
944 aa  86.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  25.87 
 
 
944 aa  85.9  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  22.82 
 
 
944 aa  85.1  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  25.33 
 
 
944 aa  84.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  25.6 
 
 
945 aa  83.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  24.02 
 
 
862 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  26.18 
 
 
852 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  24.08 
 
 
1007 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  24.35 
 
 
880 aa  75.5  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  21.43 
 
 
960 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  25.68 
 
 
1072 aa  62  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  26.3 
 
 
1082 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  26.63 
 
 
966 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  23.68 
 
 
1013 aa  56.2  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  26.15 
 
 
925 aa  54.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  22.78 
 
 
890 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  22.6 
 
 
890 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  24.77 
 
 
996 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  24.46 
 
 
996 aa  48.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  29.41 
 
 
1049 aa  48.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  23.04 
 
 
893 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  22.32 
 
 
907 aa  46.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  24.73 
 
 
996 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>