50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2204 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  100 
 
 
949 aa  1950    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  41.05 
 
 
960 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  36.98 
 
 
966 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  36.46 
 
 
1007 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  29.68 
 
 
945 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  29.6 
 
 
944 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  30.15 
 
 
944 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  29.49 
 
 
944 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  29.6 
 
 
944 aa  355  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  28.89 
 
 
945 aa  348  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  26.3 
 
 
780 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  26.33 
 
 
770 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00274  hypothetical protein  26.29 
 
 
655 aa  193  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00279  hypothetical protein  28.93 
 
 
376 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  36.87 
 
 
892 aa  104  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  25 
 
 
1160 aa  102  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  28.42 
 
 
858 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  28.42 
 
 
858 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  28.42 
 
 
853 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01372  hypothetical protein  37.8 
 
 
202 aa  94.7  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  24.5 
 
 
875 aa  89.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  22.63 
 
 
893 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  29.41 
 
 
1013 aa  78.2  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02165  ISxac3 transposase  36.61 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  29.26 
 
 
856 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  30 
 
 
852 aa  72  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  27.93 
 
 
870 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  29.02 
 
 
1049 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  31.31 
 
 
862 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  27.93 
 
 
953 aa  68.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  25.06 
 
 
947 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  25.06 
 
 
947 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  21.43 
 
 
887 aa  66.6  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  25.06 
 
 
947 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  23.56 
 
 
925 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  22 
 
 
893 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  27.78 
 
 
1072 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  27.78 
 
 
1082 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  21.11 
 
 
890 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  25.96 
 
 
996 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  25.55 
 
 
996 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  26.91 
 
 
996 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  26.32 
 
 
996 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  22.1 
 
 
907 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  26.15 
 
 
996 aa  47  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  23.18 
 
 
890 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  23.18 
 
 
890 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3851  hypothetical protein  31.33 
 
 
1104 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  24.47 
 
 
996 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  28.35 
 
 
252 aa  44.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>