24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3113 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  82.73 
 
 
996 aa  1647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  87.85 
 
 
996 aa  1802    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  92.37 
 
 
996 aa  1868    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  86.55 
 
 
996 aa  1754    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  100 
 
 
996 aa  2045    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  93.17 
 
 
996 aa  1888    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  27.55 
 
 
947 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  27.55 
 
 
947 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  27.55 
 
 
947 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  26.79 
 
 
893 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  28.15 
 
 
1007 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  30.06 
 
 
953 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  30.06 
 
 
870 aa  52  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  25.25 
 
 
890 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  23.67 
 
 
853 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  26.32 
 
 
949 aa  49.3  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  23.19 
 
 
858 aa  48.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  23.19 
 
 
858 aa  48.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  24.88 
 
 
852 aa  47.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3851  hypothetical protein  26.98 
 
 
1104 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  27.36 
 
 
945 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  22.34 
 
 
1461 aa  45.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  24.92 
 
 
1146 aa  44.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  24.26 
 
 
907 aa  44.3  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>