41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1592 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  99.37 
 
 
947 aa  1924    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  51.74 
 
 
832 aa  786    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  53.04 
 
 
953 aa  952    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  100 
 
 
947 aa  1934    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  99.37 
 
 
947 aa  1924    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  53.18 
 
 
870 aa  868    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  25.56 
 
 
880 aa  191  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  25.08 
 
 
862 aa  178  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  27.24 
 
 
856 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  26.58 
 
 
893 aa  146  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.26 
 
 
875 aa  130  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  39.27 
 
 
852 aa  129  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  25.87 
 
 
945 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  32.75 
 
 
858 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  32.75 
 
 
858 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  32.31 
 
 
853 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  23.78 
 
 
944 aa  92.8  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  31.86 
 
 
1160 aa  92  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2278  hypothetical protein  22.62 
 
 
631 aa  79.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.262759  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  28.22 
 
 
925 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  24.05 
 
 
949 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  27.54 
 
 
1013 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  25.35 
 
 
996 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  25.37 
 
 
996 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  27.55 
 
 
996 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  27.23 
 
 
252 aa  58.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  27.22 
 
 
1072 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  27.34 
 
 
996 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  25.66 
 
 
996 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  25.29 
 
 
944 aa  57.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  24.88 
 
 
944 aa  57.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  25.58 
 
 
945 aa  57.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  26.87 
 
 
996 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  27.22 
 
 
1082 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  23.55 
 
 
1007 aa  56.6  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  24.88 
 
 
944 aa  57  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  25.99 
 
 
960 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3481  hypothetical protein  22.76 
 
 
671 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.278924 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  28.49 
 
 
966 aa  55.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  31.11 
 
 
1049 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  25.68 
 
 
887 aa  45.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>