27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3616 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  84.24 
 
 
996 aa  1686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  87.85 
 
 
996 aa  1781    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  87.05 
 
 
996 aa  1790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  92.37 
 
 
996 aa  1868    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  95.28 
 
 
996 aa  1930    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  100 
 
 
996 aa  2047    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  26.87 
 
 
947 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  26.87 
 
 
947 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  26.69 
 
 
893 aa  57  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  26.49 
 
 
947 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  27.66 
 
 
1007 aa  54.7  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  24.64 
 
 
853 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  24.15 
 
 
858 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  24.15 
 
 
858 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  26.37 
 
 
1146 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  28.36 
 
 
945 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  26.49 
 
 
1142 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  24.54 
 
 
1085 aa  49.3  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.82 
 
 
875 aa  48.9  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  27.23 
 
 
953 aa  48.5  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  26.9 
 
 
852 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  28.82 
 
 
870 aa  47.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  26.16 
 
 
890 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  23.05 
 
 
1461 aa  46.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  24.73 
 
 
1160 aa  45.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3851  hypothetical protein  26.6 
 
 
1104 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  25.8 
 
 
949 aa  44.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>