16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1904 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  100 
 
 		 1142 aa  2359    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  94.19 
 
 		 1146 aa  2224    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  72.96 
 
 		 1126 aa  1731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  78.18 
 
 		 1132 aa  1867    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1085 aa  219  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003065  membrane protein putative  22 
 
 		 1173 aa  131  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02779  hypothetical protein  24.84 
 
 		 573 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1299  hypothetical protein  20.95 
 
 		 1191 aa  102  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1409 aa  97.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1174 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  23.36 
 
 		 852 aa  57  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  28.11 
 
 		 1225 aa  50.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  26.49 
 
 		 996 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  26.49 
 
 		 996 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  24.51 
 
 		 880 aa  47.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  24.14 
 
 		 862 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>