16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2535 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  94.19 
 
 
1142 aa  2224    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  100 
 
 
1146 aa  2372    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  72.78 
 
 
1126 aa  1736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  77.3 
 
 
1132 aa  1852    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  25.51 
 
 
1085 aa  221  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003065  membrane protein putative  22.35 
 
 
1173 aa  132  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02779  hypothetical protein  24.36 
 
 
573 aa  113  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1299  hypothetical protein  20.05 
 
 
1191 aa  107  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  23.06 
 
 
1409 aa  94.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  28.12 
 
 
1174 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  22.7 
 
 
852 aa  53.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  27.15 
 
 
996 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  25.29 
 
 
862 aa  52  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  26.37 
 
 
996 aa  51.6  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  28.11 
 
 
1225 aa  48.9  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  26.26 
 
 
880 aa  44.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>