25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0113 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  100 
 
 
1085 aa  2249    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  24.79 
 
 
1132 aa  243  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  25.98 
 
 
1146 aa  240  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  25.93 
 
 
1142 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  24.82 
 
 
1126 aa  234  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  24.69 
 
 
1409 aa  165  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1299  hypothetical protein  23.32 
 
 
1191 aa  122  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003065  membrane protein putative  35.04 
 
 
1173 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02779  hypothetical protein  34.9 
 
 
573 aa  116  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  26.32 
 
 
1174 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  29.23 
 
 
880 aa  56.6  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0842  hypothetical protein  27.5 
 
 
685 aa  55.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456068  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0840  hypothetical protein  28.85 
 
 
868 aa  54.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  29.73 
 
 
852 aa  52  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  29.8 
 
 
953 aa  51.6  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0041  hypothetical protein  27.63 
 
 
1099 aa  51.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  24.91 
 
 
862 aa  50.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  29.8 
 
 
870 aa  49.3  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  24.54 
 
 
996 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  24.54 
 
 
996 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  23.96 
 
 
1461 aa  46.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  23.57 
 
 
853 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  23.57 
 
 
858 aa  45.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  23.57 
 
 
858 aa  45.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  24.66 
 
 
996 aa  45.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>