40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1283 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  60.21 
 
 		 945 aa  1122    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  100 
 
 		 944 aa  1941    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1007 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  61.51 
 
 		 960 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  59.87 
 
 		 966 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  29.85 
 
 		 949 aa  366  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  27.78 
 
 		 944 aa  363  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  28.07 
 
 		 944 aa  356  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  27.92 
 
 		 944 aa  355  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  27.6 
 
 		 945 aa  349  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  26.78 
 
 		 780 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  25.22 
 
 		 770 aa  245  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00274  hypothetical protein  25.6 
 
 		 655 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  23.17 
 
 		 875 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  28.01 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00279  hypothetical protein  26.29 
 
 		 376 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  27.66 
 
 		 858 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  27.66 
 
 		 858 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  21.77 
 
 		 887 aa  101  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  23.78 
 
 		 947 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  23.8 
 
 		 947 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  23.8 
 
 		 947 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1160 aa  85.1  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  24.17 
 
 		 862 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  32.51 
 
 		 856 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  23.15 
 
 		 893 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  24.28 
 
 		 870 aa  78.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  24.19 
 
 		 953 aa  78.2  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  30.1 
 
 		 852 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  62.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  29.01 
 
 		 892 aa  63.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1072 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1082 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02165  ISxac3 transposase  33.33 
 
 		 171 aa  62  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  26.96 
 
 		 880 aa  60.1  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1049 aa  57.4  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1013 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  32.91 
 
 		 925 aa  57  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  23.39 
 
 		 832 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1299  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1191 aa  49.7  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>