18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01951 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  88.06 
 
 		 925 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  33.61 
 
 		 856 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  27.23 
 
 		 947 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  27.23 
 
 		 947 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  27.23 
 
 		 947 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  27.33 
 
 		 858 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  27.33 
 
 		 858 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  28 
 
 		 853 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  26.75 
 
 		 887 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  25.95 
 
 		 870 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  25.95 
 
 		 953 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  27.43 
 
 		 875 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1007 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1013 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  28.35 
 
 		 949 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  26.9 
 
 		 862 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  27.11 
 
 		 893 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>