14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0196 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  72.96 
 
 		 1142 aa  1731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  72.78 
 
 		 1146 aa  1736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 1126 aa  2323    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  82.98 
 
 		 1132 aa  1968    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1085 aa  213  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003065  membrane protein putative  21.82 
 
 		 1173 aa  136  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1299  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1191 aa  131  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02779  hypothetical protein  25.27 
 
 		 573 aa  124  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1409 aa  105  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1174 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  24.44 
 
 		 852 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  29.57 
 
 		 1225 aa  57.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  23.75 
 
 		 862 aa  55.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  26.49 
 
 		 880 aa  52  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>