14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003065 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02779  hypothetical protein  97.14 
 
 		 573 aa  1106    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1299  hypothetical protein  39.32 
 
 		 1191 aa  863    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003065  membrane protein putative  100 
 
 		 1173 aa  2431    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02780  hypothetical protein  80.23 
 
 		 263 aa  432  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1132 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1126 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1146 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  22 
 
 		 1142 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1085 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02805  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1409 aa  57.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69520  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1174 aa  52  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.68961 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  26.43 
 
 		 1225 aa  46.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0840  hypothetical protein  27.61 
 
 		 868 aa  45.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1461 aa  45.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>