112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1338 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  77.93 
 
 		 291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  74.07 
 
 		 301 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  66.33 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  68.86 
 
 		 280 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  64.98 
 
 		 291 aa  351  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  62.14 
 
 		 280 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  48.01 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  41.03 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  41.34 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  38.32 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  39.85 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  36.79 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  32.98 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  32.03 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  32.62 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  33.85 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  35.14 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  29.31 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  29.27 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  31.14 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  30 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  29.64 
 
 		 272 aa  96.7  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  30.74 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  27.3 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  34.55 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  35.42 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  29.18 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  28.73 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  29.18 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  28.83 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  26.35 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  29.48 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  25.09 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  27.6 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  27.96 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  27.71 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  27.96 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  27.96 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  29.27 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  29.27 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.27 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  27.96 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.27 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  29.1 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  28.52 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  28.52 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  28.52 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  29.3 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  29.27 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  29.6 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  37.96 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  27.91 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  27.91 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  27.76 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  28.69 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  26.55 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  27.27 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.75 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  32.35 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  26.09 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  31.17 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  24.32 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.51 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  30.32 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  28.57 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  27.08 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  27.59 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  24.8 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  30.14 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.65 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  26.44 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  26.83 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  28.75 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  29.75 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.94 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  30.34 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  24.56 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  25.94 
 
 		 235 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  27.68 
 
 		 435 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  25.08 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.56 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  29.7 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  28.05 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  22.3 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.56 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  31.94 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  25.28 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  29.05 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  39.73 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  29.05 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  29.05 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  27.96 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  27.96 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  27.96 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  29.05 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  28.64 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  30.41 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  28.64 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  31.43 
 
 		 395 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>